Emplacement

Le Rheu
France
France

Contrat

À plein temps, Durée indéterminée

Date de publication:

2026-09-20

Online to:

2026-11-19
EUR 20.00 HOUR

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Ingénieur En Écologie Des Communautés Et Analyse De Données (H/F)

Agence nationale de sécurité sanitaire - Anses
France
14 heures il y a

L’Anses recrute un Ingénieur en écologie des communautés et analyse de données (H/F)Poste basé à Rennes – Le Rheu (35)- Contrat à durée déterminée de droit public de 6 mois –Date de prise de fonctions : Dès que possibleRémunération : Selon l’expérience et le niveau de formation par référence aux grilles indiciaires des agences sanitaires ou selon statut particulier si fonctionnaire.Conditions particulières : Travail sous assurance qualité (ISO 17025)Travail en laboratoire confiné Vos missionsCe poste est proposé dans le cadre du projet européen Horizon Europe NemEmerge dans lequel l’unité de nématologie intervient sur les workpackages 4 et 5. Sous l’autorité du chef d’unité et sous l’encadrement direct des responsables des services de morphobiométrie et de biologie moléculaire, l'agent aura en charge l'analyse statistique de données d'écologie des communautés déjà acquises, l'évaluation de la robustesse d'un outil de qPCR récemment publié sur de nouvelles populations de nématodes à kystes (PCN), ainsi que la mise en œuvre d'un protocole expérimental visant à optimiser l'extraction de leur ADN directement à partir du sol. Il assurera également la synthèse et la restitution des résultats, participera à la rédaction d'un article scientifique ainsi qu'à la réunion annuelle d'avancement du projet.Votre équipe Le laboratoire de la santé des végétaux (LSV) est implanté sur six sites en France et est coordonné par une direction située à Angers.Le poste proposé est basé au sein de l’unité de nématologie de Rennes - Le Rheu, composée d’un effectif de 12 agents permanents et 1 doctorante. Détentrice d’un mandat de Laboratoire National de Référence (LNR) et d’un mandat Européen de Référence (LRUE) sur un périmètre couvrant les nématodes phytoparasites, l’unité de nématologie a pour principales missions :Le développement, la mise au point et la validation de méthodes d’identification de nématodes phytoparasites,La participation à des activités d’expertise et de rechercheL’animation d’un réseau de laboratoires agréés français et d’un réseau de laboratoires de référence européens (formations, suivi technique des laboratoires pour les analyses officielles déléguées, organisations d’essais interlaboratoires) dans le cadre de ses activités de référence,La réalisation d’analyses de routine et de confirmation pour la surveillance du territoire dans le respect de la norme ISO 17025,La veille scientifique et techniqueVotre quotidienActivité 1 : Analyser la structure et la diversité des communautés de nématodes dans des sols agricoles européens (dans le cadre de la tache 5.2. Characterisation of endogenous antagonists associated with PCN suppressiveness)Prendre en main, organiser, nettoyer et annoter un jeu de données issu du métabarcoding de communautés de nématodes provenant de sols agricoles de cinq pays européens.Décrire la structure des communautés de nématodes échantillonnés et mettre en œuvre sous R des analyses statistiques adaptées à l'étude de données de communautés biologiques.Étudier les associations entre taxons au sein des communautés de nématodes et évaluer l’impact de différentes variables environnementales et anthropiques associées aux sols étudiés.Activité 2 : Évaluer et optimiser des méthodes moléculaires pour l’étude des populations de Globodera pallida (dans le cadre de la tache 4.1. Identify SNPs in genomic regions linked to (a)virulence of PCN and develop a diagnostic molecular tool to monitor and manage the frequency of virulent alleles in field populations) Avec l’appui de l’équipe en place, prendre en main et mettre en œuvre un protocole de qPCR récemment publié permettant de caractériser le niveau de virulence de populations de G. pallida afin de réaliser les analyses sur différentes populations non étudiées lors du développement initial de la méthode.Mettre en œuvre un protocole expérimental visant à optimiser l'extraction d'ADN de nématodes à kystes directement à partir d'échantillons de sol.Évaluer la qualité des ADN obtenus et leur compatibilité avec les analyses moléculaires.Assurer la traçabilité, la mise en forme et la synthèse des résultats expérimentaux.Votre profilFormation et expérience requises : BAC + 3 à BAC + 5 dans les domaines de la biologie et de l’écologie, de bonnes compétences en analyses statistiques appliquées à l'écologie sont requises.Compétences : Bonne maîtrise du logiciel R et des méthodes statistiques appliquées à l'écologie ; Connaissances en écologie des communautés et en analyse de données de communautés biologiques ; Connaissances et pratique des techniques courantes de biologie moléculaire souhaitées, notamment extraction d'ADN, PCR et PCR en temps réel ; Goût pour le travail expérimental en laboratoire ; Aptitude au travail en équipe et bon esprit d'initiative dans un cadre fixé ; Connaissance del'anglais scientifique.Pour postuler :Adresser au plus tard le 02/10/26 lettre de motivation + CV en indiquant la référence 2026-122 à recrutement@anses.frL’Anses recrute, accompagne et valorise les talents dans leur diversité pour s’engager au service de la santé publique. 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